背景說明
在植物基因功能研究中,反向植物遺傳學是經典的研究思路之一,通常從一個基因入手,通過過表達、干擾或基因編輯等手段調節一個或多個基因的表達水平,觀察對應的表型變化,從而對相關基因進行一系列的分子功能研究。
基因編輯技術主要是利用序列特異性核酸酶在特定基因位點產生DNA雙鏈斷裂,借助編輯受體自身的DNA修復系統在非同源末端連接(Non-homologous end joining,NHEJ)過程中產生隨機的Indels (Small insertions and deletions)或在同源重組修復過程中插入或替換相應的基因片段,最終實現基因組序列的突變。現有的基因編輯系統主要包括鋅指核酸酶(Zinc finger nucleases,ZFNs)系統、類轉錄激活因子效應物核酸酶(Transcription activator-like effector nucleases,TALENs)系統以及CRISPR/Cas(Clustered regu-larly interspaced short palindromic repeat-associated protein)系統,其中,CRISPR/Cas系統由于載體構建過程簡單、編輯效率高等優點,成為當前廣泛應用的主流基因編輯系統。2020年,Emmanuelle Charpentier和Jennifer A. Doudna兩位科學家獲得了諾貝爾化學獎,以表彰她們在“開發CRISPR/Cas基因組編輯方法”方面作出的貢獻。
服務流程
服務內容及說明
在植物體系中,我司目前主要使用自主研發并改造后的pCAMBIA系列載體(無知識產權歸屬問題,Cambia機構已開放給任何人使用的權利,詳情請見網站 http://www.cambia.org/daisy/cambia/585)。
我司原始基因編輯載體為雙元載體,并攜帶卡納原核抗性和真核篩選標記(可選潮霉素、Basta或G418進行篩選)。我們可以針對您想要編輯的靶序列,分析序列的各項參數后設計引物,選擇最合適的原始基因編輯載體,退火合成靶序列,再連入原始載體, 得到重組子后直接進行遺傳轉化實驗。
我司部分原始基因編輯載體列表。可根據不同的需求,選擇不同的啟動子及真核抗性的載體。
適用場景
1、 功能基因的敲除;
2、 非編碼區的編輯,例如對啟動子、microRNA、lncRNA的基因序列進行編輯;
3、 單堿基編輯、精準堿基編輯;
4、 非同源/同源多基因敲除、代謝通路多基因敲除;
5、 大片段刪除。
優勢特點
1、 采用我司已被授權的國際PCT專利技術(專利號:US 10,144,936 B2)來進行sgRNA的片段組裝及無縫組裝,同時,對于單個、 多個sgRNA序列均可進行組裝;
2、 載體資源豐富,根據您研究的物種、靶序列,均有對應經多次編輯效率測試后的最優原始載體骨架推薦,也可個性化訂制您有其它需求的基因編輯載體;
3、 基因編輯載體庫中有多種真核篩選標記(可選潮霉素、Basta或G418進行篩選)的原始載體可供選擇,同時,多基因編輯、單堿基編輯、精準堿基編輯等特殊基因編輯系統也可滿足您的特殊實驗需求;
4、 載體均為雙元載體,可直接應用于后期單子葉和雙子葉遺傳轉化;
5、 可以與我司轉基因服務、檢測服務、蛋白服務等銜接,整個實驗可以暢通且快速地完成。
實驗周期
5-7個工作日
樣品接收標準
客戶下單及項目信息填寫:
在我司官網http://plant.biorun.com/進行注冊或登錄,請客戶按照頁面提示填寫項目名稱,選擇項目類型[CRISPR/Cas基因組編輯載體]、項目所需要的具體信息,價格由系統自動計算。
實驗信息
在實驗開始、結題關鍵節點系統會自動發送短信到申請人手機進行告知,實驗過程中客戶可以隨時登錄客戶管理系統査看項目實時進展情況。實驗結題后,實驗報告、檢測結果可在線査看,并永久保留。實驗過程用到的菌株、載體、受體材料免費為客戶保存半年后銷毀。
結題標準
目的片段構建至目的載體上(俗稱“構建成功”)。
實驗交付內容
1、重組載體的全序列信息和注釋信息;
2、重組載體的酶切圖譜;
3、重組載體的測序結果;
4、重組載體:一份質粒、一份大腸桿菌菌液(25%甘油菌);
5、如果需要轉化農桿菌
1)2份農桿菌菌液(25%甘油菌)
2)農桿菌的檢測圖片。